Pada babak kedua, pelatih PSM mengganti penjaga gawang Muhammad Ardiansyah dengan Hilman Syah, sedangkan Borneo memasukkan penyerang Moussa Diarra.

Tekanan Juku Eja akhirnya membuahkan hasil pada menit ke-54. Memanfaatkan assist matang dari Rizky Eka Pratama, Achmat Fahrul Aditia berhasil menyamakan kedudukan menjadi 1-1. Gol tersebut sempat ditinjau VAR sebelum disahkan oleh wasit.

Pada menit ke-59, gelandang bertahan PSM Dusan Lagator diganjar kartu kuning setelah membuat pelanggaran untuk memutus serangan cepat tuan rumah.

Pada menit ke-63, pemain PSM Mufli Hidayat diganjar kartu merah langsung oleh wasit setelah VAR mengonfirmasi tindakan tidak sportif berupa tandukan kepada Hugo Samir.

Borneo FC mencoba memanfaatkan keunggulan jumlah pemain dengan memasukkan Ikhsan Zikrak dan Muhammad Redzuan.