Godzilla Minus Zero menceritakan para penyintas Jepang setelah Perang Dunia II dan pertempuran dengan Godzilla yang begitu mematikan hingga meluluhlantakkan Ginza, Tokyo.
Film tersebut kemudian mengambil latar 1949 di kota Matsumoto yang tiba-tiba menghadapi anomali baru setelah ketiban meteor. Warga berhadapan dengan makhluk asing yang begitu mematikan.
Belakangan terungkap bahwa makhluk itu berasal dari luar angkasa, ia tiba melalui meteorit dalam wujud agar-agar yang memiliki banyak tentakel, lalu menyerap serta memangsa satwa liar setempat untuk membentuk wujud barunya.
Sebagai gabungan dari kata "chimera" dan "hydra", monster tersebut diberi nama Ghidorah. Di tengah situasi yang sudah hancur lebur, para warga juga harus berfokus pada ancaman monster raksasa baru.
Godzilla Minus Zero tayang 4 November di bioskop Indonesia.