Salah satu program yang dihadirkan adalah Shake Out Run atau lari sejauh tiga kilometer memutari kompleks candi Borobudur melalui jalur outer ring ini menjadi kesempatan bagi peserta untuk mencoba sebagian track Borobudur Marathon serta melakukan pemanasan dan beradaptasi dengan lingkungan sekitar.
Setelah Shake Out Run, kata Indung, peserta dapat mengikuti program Carbo Loading atau metode pengaturan asupan makanan untuk meningkatkan konsumsi karbohidrat agar simpanan glikogen di dalam otot menjadi optimal.
Hal itu diperlukan sebagai salah satu bagian dari persiapan pelari sebelum mengikuti Borobudur Marathon.
Selain itu, bagi para perempuan pecinta yoga dapat mengikuti aktivitas Laras Jiwa Yoga untuk mempersiapkan tubuh sekaligus menenangkan pikiran melalui perpaduan gerakan yoga, latihan pernapasan, meditasi, dan terapi suara di Halaman Lalitavistara, Komplek Candi Borobudur.