Berdasarkan hasil pendataan sementara, luas area aset KAI di kawasan Kampung Bahari mencapai sekitar 47.537 meter persegi. Pembersihan dilakukan secara bertahap dengan mempertimbangkan kondisi lapangan serta kebutuhan penanganan pada area perkeretaapian.
Adapun pengangkutan material dilakukan secara bertahap, yakni sebanyak lima gerbong pada 2 November, 20 gerbong pada 4 November, 24 gerbong pada 5 November dan sembilan gerbong pada 6 November 2026.
Seluruh material diangkut menggunakan kereta api menuju emplasemen Stasiun Tanjung Priok, kemudian dipindahkan ke truk yang disiapkan pemerintah Kota Jakarta Utara untuk dibawa keluar dari kawasan stasiun.
