Pelatih berusia 40 tahun itu diketahui tengah berjuang melawan infeksi virus yang memengaruhi kondisi kakinya selama sepekan terakhir.
Kondisi itu membuatnya tidak dapat menghadiri konferensi pers sebelum pertandingan Liga Champions melawan Arsenal di Allianz Arena, tengah pekan lalu.
Meski demikian, Kompany tetap mendampingi tim dari bangku cadangan saat Bayern ditahan imbang Arsenal 2-2 di matchday ketiga Liga Champions.
Selanjutnya, Bayern dijadwalkan menghadapi Freiburg dalam lanjutan Bundesliga, Minggu (25/10) waktu setempat. Kompany kemungkinan bakal absen memimpin pertandingan demi menjalani pemulihan lebih lanjut.
