Mesin tersebut sesuai dengan program yang telah dirancang sedemikian baiknya, pasien langsung diarahkan ke ruang pelayanan klaster yang terbagi dalam lima bagian. Klaster dua, khusus pemeriksaan bagi pasien ibu dan anak usia 0-18 tahun. Klaster ketiga untuk pelayanan kesehatan pasien dewasa dan lansia. Klaster keempat pencegahan penyakit atau P2 dan kesehatan lingkungan serta klaster kelima untuk instalasi gawat darurat, laboratorium dan farmasi.
Puskesmas Wamena juga saat ini telah berstatus sebagai badan layanan umum daerah (BLUD), sehingga pasien yang dating berobat tanpa adanya asuransi kesehatan seperti BPJS, maka akan dikenakan biaya setelah melakukan pemeriksaan dan pengobatan.
Proses pembayaran bagi pasien yang terdaftar swasta ketika tidak memiliki kartu asuransi kesehatan dilakukan di tahap akhir bukan di awal. Ini yang menjadi pengubah dari sistem-sistem pelayanan terdahulu yang pasien dikenakan biaya di awal.
Bahkan, keunggulan sistem elektronik untuk pendaftaran pasien dapat dilakukan dari rumah tanpa harus datang ke puskesmas. Ketika pasien ingin berobat di hari kerja, maka sejak pagi hari dapat dilakukan pendafraran secara daring dari rumah masing-masing, tanpa harus datang ke puskesmas.
