Deretan konflik antara penjajah dan masyarakat Paser berikut ragam penindasan yang dialami masyarakat kemudian memicu terjadinya pemberontakan Sarekat Islam di Paser pada Juli 1915. Sultan Ibrahim Chaliludin tercatat dalam dokumen para sejarawan sebagai pemimpin pemberontakan SI di Paser.
Penjajah Hindia Belanda diketahui kelimpungan memadamkan pemberontakan tersebut sampai harus mendatangkan pasukan bantuan dari Banjarmasin, Kandangan, hingga Pulau Jawa, untuk meredam perlawanan rakyat di Paser yang berlangsung selama kurang lebih 1,5 tahun.
Sultan Ibrahim Chaliludin kemudian ditangkap oleh pasukan Hindia Belanda bersama sejumlah pengurus Sarekat Islam Paser pada tahun 1918, dan mereka mendapat hukuman diasingkan seumur hidup. Sultan Ibrahim Chaliludin pertama diasingkan di Banjarmasin selama 3 tahun. Selepas itu, mereka dipindahkan ke Teluk Betung, Lampung, dan dipindahkan lagi ke Batavia, kemudian Cianjur pada tahun 1928.
