Karier kepelatihan Pochettino dimulai pada 2009. Sampai saat ini dia cuma merasakan tiga trofi, yakni saat membesut Paris Saint-Germain dengan memenangkan Ligue 1, Coupe de France, dan Trophee des Champions.

Pochettino paling lama melatih di Tottenham Hotspurs, yakni selama enam tahun. Dia sama sekali tidak bisa mempersembahkan trofi dengan pencapaian terbaiknya runner-up Piala Liga Inggris dan finalis Liga Champions.