Anggaito juga pernah menjadi Kepala Subag Bagian Pembinaan dan Fungsi Bagrenmin Divisi Hubungan Internasional Polri (Kasubbagbinfung Bagrenmin Divhubinter). Atas jabatan itu, Anggaito sering bertugas ke luar negeri.

Menurut data di laman resmi e-LHKPN Komisi Pemberantasan Korupsi (KPK), sebelum mengisi posisi Kapolres Sukoharjo per awal 2025 kemarin, Anggaito sudah pernah menjabat kapolsek, tepatnya kapolsek Metro Kebayoran Baru.

Per Januari 2025, Anggaito Hadi Prabowo resmi menjalankan tugas sebagai Kapolres Sukoharjo menggantikan AKBP Sigit. Ini adalah pertama kalinya Anggaito mengemban amanah kapolres.