Ia kemudian pernah menjabat sebagai Komisaris Pelindo II pada masa pemerintahan Presiden Susilo Bambang Yudhoyono (SBY). Pada 2010, Syahganda mendirikan Sabang Merauke Circle (SMC), lembaga kajian/konsultasi yang bergerak di bidang politik dan kebijakan publik.

Nama Syahganda sempat menjadi perbincangan 2020 ketika ia menjadi salah satu tokoh Koalisi Aksi Menyelamatkan Indonesia (KAMI).

Kemudian, pada masa pemerintahan Prabowo, ia ikut mendirikan lembaga think tank, GREAT Institute. Lembaga ini merupakan lembaga riset bidang ekonomi, politik dan teknologi.

Presiden Prabowo kemudian melantik Syahganda sebagai Kepala Badan Komunikasi Pemerintah (Bakom) menggantikan Muhammad Qodari. Pelantikan berlangsung di Istana Negara dan didasarkan pada Keppres Nomor 106/P Tahun 2026.