Situasi yang membuat manusia putus asa itu membuat para ahli kepikiran mengadu Ghidorah dan Godzilla untuk mengakhiri permasalahan.
Kōichi Shikishima masih diperankan Ryunosuke Kamiki. Shikishima merupakan mantan pilot kamikaze yang sebelumnya berhadapan langsung dengan Godzilla. Dua tahun setelah itu, ia membangun keluarga kecilnya bersama Noriko dan Akiko.
Saat merasa hidupnya berjalan normal, ia dihadapkan dengan fakta bahwa Jepang masih berhadapan dengan makhluk raksasa yang begitu mematikan. Situasi itu membuatnya terpaksa kembali ke situasi yang ia coba tinggalkan.
Noriko Shikishima juga masih diperankan oleh Minami Hamabe. Ia merupakan istri Koichi sekaligus penyintas serangan mematikan Godzilla di Ginza, Tokyo.
Meski berhasil bertahan dan sembuh hingga dua tahun, Noriko kini memiliki tanda hitam misterius yang menyerupai dampak radiasi dan diduga berkaitan dengan sel-G yang menjalar di lehernya.
Tanda itu dan kelangsungan hidup Noriko ternyata menjadi elemen penting saat Jepang berhadapan dengan ancama baru, yakni kemunculan King Ghidorah pasca-perang.
Kanji Murakami diperankan Min Tanaka. Karakter ini merupakan ilmuwan sekaligus ahli biologi penyintas peristiwa pengeboman Hiroshima pada Perang Dunia II yang menewaskan seluruh anggota keluarganya.
