Dalam kasus yang jarang terjadi, infeksi Zika juga dapat memicu sindrom Guillain-BarrΓ© (GBS), yaitu kondisi ketika sistem kekebalan tubuh menyerang sel saraf sehingga menyebabkan kelemahan otot hingga kelumpuhan. Sebagian besar pengidap dapat pulih, meski beberapa orang dapat mengalami kerusakan saraf permanen.
Selain itu, dalam kasus yang sangat jarang, Zika dapat menyebabkan komplikasi serius yang menyerang otak dan sistem saraf, seperti radang otak (ensefalitis), radang selaput otak (meningitis), atau radang sumsum tulang belakang (mielitis). Infeksi ini juga dalam kasus tertentu dapat menyebabkan gangguan darah yang memicu perdarahan, memar, atau proses pembekuan darah yang lebih lambat.