Setelah Proklamasi Kemerdekaan Indonesia, AM Sangadji juga terlibat dalam penyebaran berita kemerdekaan di Kalimantan. Ia kemudian memimpin Laskar Hizbullah yang berpusat di Yogyakarta.
AM Sangadji meninggal dunia di Yogyakarta pada 20 April 1949 setelah ditembak di kediamannya. Perjuangannya melalui organisasi, tulisan, dan kegiatan politik menjadikannya salah satu tokoh pergerakan nasional dari Indonesia timur.
Pemerintah Republik Indonesia menganugerahkan gelar Pahlawan Nasional kepada 19 tokoh bertepatan dengan peringatan Hari Pahlawan pada 10 November 2026. Upacara penganugerahan dipimpin langsung Presiden RI Prabowo Subianto di Istana Negara, Jakarta, Selasa (10/11) siang.
