Pada Senin, pembatalan meliputi penerbangan Trigana Air menuju Namrole dan Sanana, Smart Air menuju Wahai dan Banda Neira, Garuda Indonesia menuju Jakarta, Lion Air menuju Sorong, Surabaya, Langgur, dan Makassar, serta Wings Air menuju Ternate.
Sementara pada Selasa, pembatalan terjadi pada penerbangan Wings Air menuju Saumlaki dan Ternate, Batik Air menuju Makassar dan Nabire, Lion Air menuju Jakarta, Trigana Air menuju Moa, serta Garuda Indonesia menuju Jakarta.
Johan mengatakan, pihak bandara tetap mengoptimalkan pelayanan bagi penumpang yang terdampak pembatalan penerbangan, termasuk menjaga kenyamanan ruang tunggu, memastikan pendingin ruangan berfungsi dengan baik, serta menyiagakan petugas untuk memberikan informasi dan arahan.
Penumpang yang penerbangannya dibatalkan diarahkan menuju loket layanan pelanggan masing-masing maskapai untuk mengurus pengembalian dana tiket (refund) atau penjadwalan ulang penerbangan (reschedule).