Berikut perjalanan skor PISA Siswa Indonesia berdasarkan hasil setiap periode penilaian.

Pada keikutsertaan pertama Indonesia, skor PISA Indonesia tahun 2000 untuk membaca adalah 371. Matematika dengan skor 367 dan skor untuk sains 393.

Pada 2003, hasil PISA Indonesia adalah:

Sains mulai menjadi salah satu bidang yang diukur dalam PISA pada 2006. Indonesia memperoleh:

- Membaca: 393- Matematika: 391- Sains: 393

Pada PISA 2009, untuk kemampuan sains, Indonesia memperoleh skor 383, sedangkan rata-rata OECD mencapai 501.

Kemampuan membaca Indonesia mencatat skor 402, dibandingkan rata-rata OECD sebesar 493. Sementara matematika menjadi bidang dengan skor terendah, yakni 371, dengan rata-rata OECD 496.