Menteri Transportasi Spanyol, Γ“scar Puente, menyebut kecelakaan itu benar-benar sulit dipercaya. Dia mengatakan penyelidikan awal menunjukkan bahwa kecelakaan tersebut dipicu oleh perintah yang 'tidak dapat dijelaskan' dari pihak pengatur lalu lintas kereta api.

Perintah itu, katanya, mengizinkan salah satu kereta cepat untuk terus melaju. Padahal saat itu sedang terjadi gangguan keselamatan yang menyebabkan sebuah kereta berhenti di jalur yang sama.

Menurut Puente, kegagalan sistem komputer sempat menghentikan enam kereta yang sedang melaju. Termasuk, katanya, dua kereta yang kemudian terlibat tabrakan.