Namun, kedamaian yang baru saja mekar itu mendadak sirna saat malapetaka baru kembali menerjang. Entitas purbakala nan mengerikan yang dikenal sebagai King Ghidorah alias Monster Zero mendadak muncul dan meratakan berbagai kota.

Kehadiran King Ghidorah pun menimbulkan kehancuran parah di kawasan Matsumoto. Ghidorah pun menjadi ancaman baru karena begitu sulit dibunuh. Alih-alih mati, ia malah berevolusi.

Situasi yang membuat manusia putus asa itu membuat para ahli kepikiran mengadu Ghidorah dan Godzilla untuk mengakhiri permasalahan.

Godzilla Minus Zero tayang 4 November di bioskop Indonesia.