Badan Informasi Geospasial (BIG): menyediakan dan mengoordinasikan informasi geospasial untuk berbagai kebutuhan pembangunan.
Badan Intelijen Negara (BIN): menyelenggarakan fungsi intelijen untuk mendukung keamanan nasional.
Badan Kepegawaian Negara (BKN): mengelola kebijakan dan administrasi kepegawaian aparatur sipil negara.
Badan Kependudukan dan Keluarga Berencana Nasional (BKKBN): menjalankan kebijakan pembangunan keluarga, kependudukan, dan keluarga berencana.
Badan Koordinasi Penanaman Modal (BKPM): mendukung koordinasi kebijakan dan pelayanan penanaman modal.
Badan Meteorologi, Klimatologi, dan Geofisika (BMKG): menyediakan informasi cuaca, iklim, kualitas udara, dan gempa bumi.
Badan Narkotika Nasional (BNN): mengoordinasikan pencegahan dan pemberantasan penyalahgunaan serta peredaran gelap narkotika.
Badan Nasional Penanggulangan Bencana (BNPB): mengoordinasikan penanggulangan bencana, mulai dari pencegahan hingga pemulihan.
Badan Nasional Penanggulangan Terorisme (BNPT): mengoordinasikan kebijakan pencegahan dan penanggulangan terorisme.
Badan Penyelenggara Jaminan Produk Halal (BPJPH): menyelenggarakan kebijakan dan layanan sertifikasi halal.
Badan Pelindungan Pekerja Migran Indonesia (BP2MI): dalam nomenklatur terbaru, fungsi pelindungan pekerja migran dijalankan oleh kementerian terkait; nama lembaga perlu dibaca sesuai perubahan kelembagaan yang berlaku.
Badan Pengawasan Keuangan dan Pembangunan (BPKP): melaksanakan pengawasan intern terhadap keuangan dan pembangunan pemerintah.
Badan Pertanahan Nasional (BPN): menangani administrasi pertanahan melalui struktur kementerian yang membidangi agraria dan tata ruang.
