Dalam memberikan pelayanan, rumah sakit kapal ini memiliki fasilitas setara rumah sakit umum daerah Tipe C, meliputi poliklinik spesialis dan dokter umum, ruang rawat inap, unit gawat darurat, serta ruang operasi yang beroperasi selama 24 jam untuk kasus darurat.

Untuk tindakan bedah, RS Kapal ini memiliki dua ruang operasi mayor yang dilengkapi fasilitas anestesi. Operasi darurat dapat dilakukan selama 24 jam, sedangkan operasi terencana dijadwalkan pada Senin hingga Jumat.

"Pasien yang membutuhkan penanganan lebih lanjut atau memiliki kondisi yang belum dapat ditangani di rumah sakit kapal akan dirujuk melalui kerja sama dengan rumah sakit di Kota Tual dan Langgur," ujar Josepha.