Ia berada di Arsenal sejak 2011 hingga menembus tim utama The Gunners dua tahun berselang pada usia 18 tahun. Gnabry membela Arsenal hingga 2016. Meski begitu, ia tak banyak bermain untuk Meriam London dengan cuma tampil dalam 18 laga dengan sumbangan satu gol dan satu assist.

Gnabry sebelumnya sudah dua kali berhadapan dengan Arsenal saat sudah berseragam Bayern Munich di Liga Champions. Hal terjadi pada musim 2024/2025 dan 2025/2026.

Gnabry tiga musim secara beruntun bertemu dengan Arsenal. Pemain 31 tahun ini menilai selalu spesial bertemu dengan Arsenal.